Cuộc phiêu lưu tiếp tục khi Go và Satoshi tiến xa hơn trên hành trình nghiên cứu và Go tham gia Dự án Mew. Nhưng Mew không phải là Pokémon Huyền Thoại duy nhất!......

Nhà huấn luyện trẻ tuổi Satoshi và người bạn mới Go trở thành nghiên cứu sinh tại phòng nghiên cứu của Giáo sư Sakuragi. Họ đi khắp thế giới để tìm hiểu về Pokémon.......

Hai nhà vô địch du hành thời gian về Lưỡng Hà cổ đại để chiến đấu với các nữ thần và ác quỷ – họ là phòng tuyến cuối cùng trước nguy cơ diệt vong của loài người.......